まぁWebサーバーのほとんどがApacheなのはそうだよなぁ。
でもネームサーバーの全てがBINDだというのはちょっとダウト。djbdnsで何の問題も無く運用できているよ。
Apacheはさすがに機能テンコ盛で、代替になるセキュア志向のソフトは見当たらない。他にもZeusとか超大手は使っているらしいけど。