どうして正かなを隔離したがるのだらう。

隔離ではなく分類です。
正字正かなづかいでWikiキーワードを書かれると、はてなダイアリーのシステム上は同一の単語とはならないから。という技術的なことを書いているだけです。
だから「CSSコミューン国（いるのか?）」はWikiキーワードを分類する必要は無いですが、「English日記国（いるのか?）」「実体参照国（これは居ない）」は分類する必要が有ります。
「タグのValidがどうとかCSSコミューンはうるさいなぁ」と迫害されている（ように感じる）のと同じ原理で、「正字正かなづかい日記の人たちはウザイなぁ」と迫害されている（ように感じる）ってのの延長線上にオレの「はてなダイアリーも「ふつう国」「正かなづかい国」「愛蔵太国」の3つに分けて」というネタが来たと勘違いされているのかも。
このネタはlovelovedogさんは過去の実績から言って「まぜるな危険」なんだから。というネタです。（いっその事、三枝さんをはてなダイアリーにスカウトして、二人だけでWikiを作ってもらうのが……）
はてなダイアリー側で、技術によって正字正かなづかいによるキーワードWikiが混在することを解決するのであれば分類する必要性は感じなくなるでしょう。
もちろん技術者たる実装家が苦労して、ブラウズする一般人が苦労しないのが理想なので「正字正かなづかいがWikiに混在していても問題ない」と現状を許容する。のは問題がアリだと感じます。